胡家铭，赖旭龙*，盛桂莲*等，BGEG国家重点实验室/地球科学学院/环境学院， Proceedings B (2022), An extinct and deeply divergent tiger lineage from Northeastern China recognized through palaeogenomics

        2022年7月27日，我校赖旭龙教授领导的古DNA团队与吉林大学、丹麦哥本哈根大学合作研究的成果“An extinct and deeply divergent tiger lineage from Northeastern China recognized through palaeogenomics（古基因组研究发现中国北方一支已灭绝且深度分化的老虎支系）” 在线发表于Nature Index期刊《Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences》。地球科学学院博士生胡家铭为第一作者，赖旭龙教授和盛桂莲教授为通讯作者。 

老虎作为大型猫科动物中的明星，在生物学分类上属于猫科、豹属、虎种，其演化历史、生存状态均受到社会和学界的广泛关注。现生老虎包括六个地理亚种：西伯利亚虎（东北虎）、华南虎、印支虎、孟加拉虎（印度虎）、马来虎、苏门答腊虎，已有研究认为它们均分化自一个距今约11万年的祖先种群。迄今为止，最古老的老虎化石发现于我国甘肃距今超过200万年的早更新世，其它中、晚更新世的虎化石也遍及东亚，它们与现生虎的演化关系尚未明确。古DNA技术能探究这些化石个体的遗传身份，可从古代分子视角解析老虎演化历史提供新的证据。 

该研究成功获得了世界首例老虎古基因组数据，结果显示该个体不同于所有现生老虎，属于此前未知且现已灭绝的遗传支系；分子演化速率计算结果表明该个体代表的遗传支系约于26万年前与现生老虎发生分歧，该时间节点远早于现生老虎的分歧时间（约11万年前）。结合现生老虎的基因组数据，该研究讨论了现生虎的祖先与古虎可能发生的基因交流事件，丰富了老虎演化历史的细节。 

图1 老虎演化历史

a) 老虎母系有效种群动态变化； b) 老虎线粒体系统发育关系

世界首例老虎古基因组来自2003年从吉林通化大安溶洞采集到的一件老虎下颌化石标本（实验室编号CADG482，碳14测年结果为超过43500年），性染色体分析显示该个体为雄性。该研究揭示了更为久远和复杂的老虎演化历史，彰显了古基因组分析在老虎演化问题上的巨大研究潜力。该研究得到了国家自然科学基金项目（编号：42172027 & 41672017）资助。

图2 吉林通化大安溶洞古虎化石（CADG482）

论文信息：

Title：An extinct and deeply divergent tiger lineage from Northeastern China recognized through palaeogenomics

Authors：Jiaming Hu, Michael V. Westbury, Junxia Yuan, Chunxue Wang, Bo Xiao, Shungang Chen, Shiwen Song, Linying Wang, Haifeng Lin, Xulong Lai & Guilian Sheng.

Source: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences

DOI：10.1098/rspb.2022.0617